目前的生态厕所应用率最多的是微生物菌种合成粪便的厕所，它应用其生长繁衍活动对粪便中可应用的大分子有机化合物停止生物降解并转化为菌体生物量，竞争性的抑止并杀死粪便中的病原性微生物，吸附、降解、转化粪便中产生的臭味物质。
　　完成了粪便的无害化、资源化处置。能到达零排放的功用，对环境完整不形成任何污染。对生态厕所的称谓有多种：生态环保厕所、生物厕所、微生物厕所、干式搅拌厕所等等。生态厕所按其开展完善过程可分为。


　　模拟型生态厕所，是在国外引进机的根底上模拟而成的，特征是粪尿直入主机，停止生物处置。改良型生态厕所， 在第一代的根底上，依据国情改良成型的，特征是粪尿别离，大便直入主机，停止生物处置；小便引出主机进入其它系统处置排放。


　　完善型生态厕所，在第二代的根底上，增加负压通风系统，充沛改善了厕内的如厕环境。创新型生态厕所，是生态厕所开展的里程碑，它有许多关键点的打破，比方动态的固液别离器；自动出渣安装；用电量的大幅降落等等。

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